De naam Nagelkruid valt te herleiden tot het Knikkend nagelkruid (Geum rivale) waarvan de geur van de wortels doet denken aan Kruidnagel (Syzygium aromaticum) De soortnaam urbanum verwijst naar het stedelijk gebied waar de plant in het verleden, en ook nu vaak, werd en wordt aangetroffen.