Klokjesgentiaan is een plant van licht vochtige, licht zure schrale grond. Vroeger was deze plant redelijk algemeen, maar nu is het een bijzondere en zeldzame soort. Het Gentiaanblauwtje (Phengaris alcon) is de zeldzame vlinder welke eitjes afzet op Klokjesgentiaan. De rupsen eten de bloemen op en laten zich daarna op de grond vallen om te wachten op een lift van een steekmier, zodat de rups zich kan verpoppen in het nest van deze mieren.